Здравствуйте. Кисты желтого тела - это кисты транзиторные, которые при нормализации гормонального фона самостоятельно рассасываются, что скорее всего и произошло. Что за кисточки были выявлены у Вас в дальнейшем - не совсем понятно. Кисты яичника бывают различного происхождения, на фоне гормонального дисбаланса, как результат воспалительных процессов, эндометриоидные, дермоидные и другие. Боли в области малого таза не всегда связаны с половыми органами. существует так называемый синдром тазовых болей, который может возникать как результат кишечной патологии (синдром раздраженного кишечника, например), эндометриоза, спаечного процесса, а также варикозного расширения вен малого таза. Что касается шишки, которую Вы ощущаете, это скорее всего шейка матки. Понятия "стержень матки" не существует. Возможно, на шейке матки есть ретенционны кисты, которые бывают больших размеров, может одну из таких кист Вы и чувствуете. Но ретенционные кисты шейки матки и влагалища никакого отношения к кистам яичника не имеют и обычно не вызывают болевых ощущений. Сходите на кольпоскопию для диагностики шейки матки.